1、网上申请：登录深圳市公安局出入境便民网，按要求填写申请表，预约后前往出入境管理部门办理。
2、窗口申请：携带相关材料到深圳市出入境管理部门窗口办理。
3、自助机办理：在深圳市部分出入境管理部门设有自助机，可凭通行证自助办理签注。
建议参考：
1、准备好所需材料，如身份证、通行证等。
2、提前了解办理流程和所需时间，合理安排时间。
3、按照预约时间前往办理，避免长时间等待。
4、如有疑问，可咨询出入境管理部门的工作人员。
相关法条：
《中华人民共和国出境入境管理法》第十条：中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定，具体管理办法由国务院规定。
以上内容具体告诉你关于如何在深圳办理港澳通行证签注的问题的答案，除此之外，本文还介绍了港澳通行证在深圳签注怎么办理的具体流程。相信你已经从文中得到了你想要的答案。如果您还想咨询如何在深圳办理港澳通行证签注的相关问题，可以咨询相关律师。
